Na temelju Zakona o područjima i sjedištima sudova "Narodne novine" broj 67/18 Trgovački sud u Zagrebu nadležan je za područje Karlovačke, Krapinsko-zagorske, Sisačko-moslavačke i Zagrebačke županije te Grada Zagreba.
Trgovački sud u Zagrebu nadležan je i za područje Trgovačkog suda u Bjelovaru i Trgovačkog suda u Varaždinu za rješavanje sporova koji se odnose na brodove i plovidbu na moru i unutarnjim vodama i na sporove na koje se primjenjuje plovidbeno pravo; zrakoplove i na sporove na koje se primjenjuje zračno plovidbeno pravo; zaštitu i uporabu industrijskog vlasništva, autorskog prava i srodnih prava i drugih prava intelektualnog vlasništva, na zaštitu i uporabu izuma i tehničkih unapređenja te tvrtke, ako posebnim zakonom nije drukčije određeno.
Sukladno čl. 21. Zakona o sudovima (NN 67/18) Trgovački sudovi:
- odlučuju u parničnim i izvanparničnim stvarima kada je to propisano posebnim zakonom,
- postupaju u registarskim stvarima i vode sudske registre,
- odlučuju o prijedlozima u svezi s osnivanjem, radom i prestankom trgovačkog društva,
- odlučuju o prijedlozima za otvaranje stečajnog postupka i provode predstečajne i stečajne postupke,
- odlučuju o upisima u upisnik brodova i jahti u onim stvarima koje su Pomorskim zakonikom stavljene u nadležnost trgovačkog suda, ograničenju odgovornosti brodara, prigovorima protiv konačne diobene osnove za likvidaciju zajedničke havarije, ako zakonom za pojedinu vrstu predmeta nije drukčije određeno,
- provode postupak priznanja inozemnih sudskih odluka, kao i arbitražnih odluka u trgovačkim sporovima,
- provode osiguranje dokaza za postupke za koje su inače nadležni,
- određuju mjere osiguranja u postupcima i povodom postupaka u kojima su inače nadležni,
- obavljaju poslove međunarodne pravne pomoći u izvođenju dokaza u trgovačkim stvarima,
- obavljaju i druge poslove određene zakonom.